从全国中学三年生中选出被认为是最不良的一个班级，令其所有成员在一起自相残杀直至仅余最后一人存活的游戏法则——新世纪教育改革法，通称“BR”。
三日之内，要么将身边所有同伴杀死，要么等着自己被杀，道路残酷而唯一。而当年最终从这种极限状态中脱逃，残活下来的人，他们后来如何？
在七原秋也与中川典子从BR中脱身，离开孤岛的两年之后，人类世界进入了恐怖主义时代。首都在反BR国家的“恐怖分子”手下被炸为废墟，政府当局将这次事件的凶犯判定为七原，并开始了对其的国际通缉。
首都崩坏之后一年……七原做为反BR法组织“wild seven”的领袖，对所有的成人发布了宣战通告。成人们为了剿杀七原，便籍着反恐的正义之名，计划了一次新游戏——新世纪反恐对策特别法，通称BRⅡ。
这样的背景之下，某天，汇集了来自全国各地的不良少年，以及逃课问题生的鹿之砦中学校的3年B组42名孩子，在圣诞节休学旅行通往滑雪学校的路途中，沦为了军队的劫持目标，被全员绑架到了一座孤岛之上。当他们被勒令换上军服，并押送集合至一个巨大军营之内时，他们的指导教师RIKI却出现了。“整个班级无一人例外，将成为本次BRⅡ的参加者”，RIKI向已经陷入混乱的学生们，公布了绑架理由，并说明了BRⅡ的游戏规则。
BRⅡ规则：
1，将潜伏在孤岛之内的恐怖分子七原等全部歼灭者为胜。2，限时为三天。3，采取二人组合接力形式，交替作战，并生死诛连。
如此，不允许发表任何异议，孩子们集体被强制加入了这场镇压恐怖分子的战斗。他们中，有人因在首都爆炸事件中丧失了全部亲人，而确实对七原怀抱着恨意与复仇的决心，但是也有人拒绝合作，抵死不从被当场射杀。而跟被杀者同一出席番号的另一组员，因为新游戏的生死诛连规则，颈上的金属项圈自动爆破，亦随之丧命。剩下的这40名学生们，则按照出席号码的顺序，被迫乘上6艘自动艇，向着最前线的“战场”出发了。
孩子们奋力滑动着剧烈晃动的小艇，浑身被激浪所拍湿，竭尽所有可能不顾一切向着孤岛进发。然而当他们最后终于即将登陆的时刻，恐怖分子的攻击却开始了。光弹交织，迫击炮在水面上不断炸响。面对这样的突发状况，惊愕交集的学生们只有躲闪之力，而无还击的准备。有的人全身被子弹穿透如蜂巢，有的人被迎面飞来的炮弹击中高高飞起。Wild Seven的成员们，并不知道前来进攻七原的这些身着军装的人，竟然是一群中学学生，因此怀揣着对BR国家宣战的全部信念，誓死发动着攻击。在枪林弹雨和爆炸的火光中终于登上了陆面的学生们，因为弹药告罄本欲暂行撤退，然而，炮火却不歇不缓地接踵袭来，令人毫无藏身之处。战斗到此刻，只剩下了26名成员的学生们终于醒悟到：原来他们早已经走投无路。于是只有毅然端起了武器，被卷入到成人所阴谋策划的，另一次孩子们自相残杀的战争游戏中去。而到最后，他们以及七原秋也，到底将会沦为何种命运呢……
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