《妙手仁心2》是以一个以公立医院作背景的剧集，透过一群医务人员的工作态度、思想及不同病例，道出人生的悲欢离合，生老病死。以包涵、同情及关怀，打破人与人之间的不沟通和隔膜，从而对生命有多一份珍惜。
承接着上一辑的《妙手仁心》，两年后的今天，我们的主角亦各有转变。风流不羁的黎国柱Henry（林保怡饰）与冷静聪明的Annie江新月（陈慧珊饰），为延续两人的爱情，力持着亲蜜爱人却不愿同居的两性关系。Annie的弟弟江满月Gilbert（苏永康饰）于一年前因艾滋病发逝世，离去前数月，满月于街上拾回小狗仔仔，如今成为轮流寄养于各人家中的小狗。张创业（张家辉饰）与阿茵（汤盈盈饰）已婚且于英国定居，而乐观多言的张家裕阿Joe（马浚伟饰）与Helen（陈芷菁饰）则于非洲穷乡中从事医疗工作。当周遭各人各有离合时，我们的主角程至美阿Paul（吴启华饰）仍坚守着他的岗位及人生态度，拯救病人于死亡边缘，每天盼望着那昏迷两载的女友唐姿礼Jackie（蔡少芬饰）醒过来。一切在院长罗孝齐（张同祖饰）领导下，平淡如水，直至三位年青医生的加入，为原有这班人加添了欢笑及动力，从而对自我及生命有进一步的了解。
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